MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nocardioides sp. JS614 plasmid pNOCA01

Total Repeats: 7654

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008697	CGC	2	6	34	39	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_008697	GGC	2	6	41	46	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008697	GCT	2	6	73	78	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008697	GA	3	6	88	93	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008697	CGGCG	2	10	98	107	0 %	0 %	60 %	40 %	119714008
6	NC_008697	CGAC	2	8	117	124	25 %	0 %	25 %	50 %	119714008
7	NC_008697	GTTG	2	8	305	312	0 %	50 %	50 %	0 %	119714008
8	NC_008697	TCG	2	6	348	353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714008
9	NC_008697	CG	4	8	391	398	0 %	0 %	50 %	50 %	119714008
10	NC_008697	ATCC	2	8	419	426	25 %	25 %	0 %	50 %	119714008
11	NC_008697	AAC	2	6	438	443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119714008
12	NC_008697	CGT	2	6	478	483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714008
13	NC_008697	TCG	2	6	498	503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714008
14	NC_008697	GCTG	2	8	507	514	0 %	25 %	50 %	25 %	119714008
15	NC_008697	TCT	2	6	643	648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119714008
16	NC_008697	TCGA	2	8	653	660	25 %	25 %	25 %	25 %	119714008
17	NC_008697	TCG	2	6	768	773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714009
18	NC_008697	GC	3	6	784	789	0 %	0 %	50 %	50 %	119714009
19	NC_008697	TCA	2	6	801	806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119714009
20	NC_008697	GC	3	6	828	833	0 %	0 %	50 %	50 %	119714009
21	NC_008697	GCGA	2	8	837	844	25 %	0 %	50 %	25 %	119714009
22	NC_008697	CGG	2	6	846	851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714009
23	NC_008697	CAG	2	6	869	874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714009
24	NC_008697	CG	3	6	889	894	0 %	0 %	50 %	50 %	119714009
25	NC_008697	CGG	2	6	900	905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714009
26	NC_008697	GCAC	2	8	978	985	25 %	0 %	25 %	50 %	119714009
27	NC_008697	CA	3	6	1000	1005	50 %	0 %	0 %	50 %	119714009
28	NC_008697	G	6	6	1022	1027	0 %	0 %	100 %	0 %	119714009
29	NC_008697	TCGA	2	8	1032	1039	25 %	25 %	25 %	25 %	119714009
30	NC_008697	CGT	2	6	1126	1131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714009
31	NC_008697	GCC	2	6	1148	1153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714009
32	NC_008697	CAAC	2	8	1163	1170	50 %	0 %	0 %	50 %	119714009
33	NC_008697	ACG	2	6	1194	1199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714009
34	NC_008697	CG	3	6	1198	1203	0 %	0 %	50 %	50 %	119714009
35	NC_008697	CCG	2	6	1225	1230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714009
36	NC_008697	TCCT	2	8	1337	1344	0 %	50 %	0 %	50 %	119714010
37	NC_008697	GCC	2	6	1353	1358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714010
38	NC_008697	CGCCGG	2	12	1361	1372	0 %	0 %	50 %	50 %	119714010
39	NC_008697	GC	3	6	1399	1404	0 %	0 %	50 %	50 %	119714010
40	NC_008697	CGGCA	2	10	1430	1439	20 %	0 %	40 %	40 %	119714010
41	NC_008697	GAG	2	6	1460	1465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119714010
42	NC_008697	GAG	2	6	1469	1474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119714010
43	NC_008697	GC	3	6	1507	1512	0 %	0 %	50 %	50 %	119714010
44	NC_008697	CGC	2	6	1520	1525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714010
45	NC_008697	CGA	2	6	1555	1560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714010
46	NC_008697	GCG	2	6	1625	1630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714010
47	NC_008697	GCC	2	6	1643	1648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714010
48	NC_008697	TCG	2	6	1683	1688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714010
49	NC_008697	GT	3	6	1705	1710	0 %	50 %	50 %	0 %	119714010
50	NC_008697	CGC	2	6	1751	1756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714010
51	NC_008697	TGCGT	2	10	1812	1821	0 %	40 %	40 %	20 %	119714010
52	NC_008697	CGG	2	6	1837	1842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714010
53	NC_008697	CG	3	6	1844	1849	0 %	0 %	50 %	50 %	119714010
54	NC_008697	TGC	2	6	1853	1858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714010
55	NC_008697	CAG	2	6	1911	1916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714010
56	NC_008697	GCG	2	6	1924	1929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714010
57	NC_008697	GCC	2	6	1937	1942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714010
58	NC_008697	GAG	2	6	1973	1978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119714010
59	NC_008697	CAG	2	6	2012	2017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714010
60	NC_008697	TGCC	2	8	2050	2057	0 %	25 %	25 %	50 %	119714011
61	NC_008697	TCG	2	6	2100	2105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714011
62	NC_008697	TGG	2	6	2106	2111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119714011
63	NC_008697	GTC	2	6	2123	2128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714011
64	NC_008697	CGT	2	6	2159	2164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714011
65	NC_008697	CGG	2	6	2197	2202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714011
66	NC_008697	GTC	2	6	2228	2233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714011
67	NC_008697	CGA	2	6	2242	2247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714011
68	NC_008697	GTT	2	6	2276	2281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119714011
69	NC_008697	GCC	2	6	2357	2362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714011
70	NC_008697	GCG	2	6	2363	2368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714011
71	NC_008697	CACGG	2	10	2384	2393	20 %	0 %	40 %	40 %	119714011
72	NC_008697	GTG	2	6	2442	2447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119714011
73	NC_008697	TGGCGA	2	12	2467	2478	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119714011
74	NC_008697	CGG	2	6	2530	2535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714011
75	NC_008697	GCT	2	6	2575	2580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714011
76	NC_008697	CGA	2	6	2608	2613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714011
77	NC_008697	GCG	2	6	2640	2645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714011
78	NC_008697	GCC	2	6	2652	2657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714011
79	NC_008697	TCG	2	6	2694	2699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714011
80	NC_008697	CTG	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714011
81	NC_008697	GTC	2	6	2714	2719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714011
82	NC_008697	GCC	2	6	2731	2736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714011
83	NC_008697	TGC	2	6	2737	2742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714011
84	NC_008697	TGT	2	6	2743	2748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119714011
85	NC_008697	ACC	2	6	2769	2774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119714012
86	NC_008697	GTC	2	6	2785	2790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714012
87	NC_008697	CGT	2	6	2853	2858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714012
88	NC_008697	GCT	2	6	2868	2873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714012
89	NC_008697	TCG	2	6	2909	2914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714012
90	NC_008697	TGCT	2	8	2939	2946	0 %	50 %	25 %	25 %	119714012
91	NC_008697	TCC	2	6	3017	3022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119714012
92	NC_008697	GTA	2	6	3052	3057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119714012
93	NC_008697	TGC	2	6	3149	3154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714012
94	NC_008697	CCT	2	6	3267	3272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119714012
95	NC_008697	CTG	2	6	3298	3303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714012
96	NC_008697	GCT	2	6	3306	3311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714012
97	NC_008697	TCG	2	6	3327	3332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714012
98	NC_008697	CAT	2	6	3376	3381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119714012
99	NC_008697	GCG	2	6	3398	3403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714012
100	NC_008697	TCG	2	6	3444	3449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714012
101	NC_008697	GCT	2	6	3456	3461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008697	TCGG	2	8	3511	3518	0 %	25 %	50 %	25 %	119714013
103	NC_008697	GC	3	6	3570	3575	0 %	0 %	50 %	50 %	119714013
104	NC_008697	CAG	2	6	3603	3608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714013
105	NC_008697	GAT	2	6	3651	3656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119714013
106	NC_008697	GCT	2	6	3692	3697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714013
107	NC_008697	GCG	2	6	3702	3707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714013
108	NC_008697	CGGC	2	8	3713	3720	0 %	0 %	50 %	50 %	119714013
109	NC_008697	CGC	2	6	3736	3741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714013
110	NC_008697	CG	4	8	3782	3789	0 %	0 %	50 %	50 %	119714013
111	NC_008697	TGG	2	6	3812	3817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119714013
112	NC_008697	GCC	3	9	3861	3869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714013
113	NC_008697	ACC	2	6	3874	3879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119714013
114	NC_008697	GTT	2	6	3882	3887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119714013
115	NC_008697	GCC	2	6	3941	3946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714013
116	NC_008697	TCG	2	6	4039	4044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714013
117	NC_008697	GGGC	2	8	4059	4066	0 %	0 %	75 %	25 %	119714013
118	NC_008697	GCC	2	6	4070	4075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714013
119	NC_008697	CAG	2	6	4130	4135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714013
120	NC_008697	TCA	2	6	4136	4141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119714013
121	NC_008697	GTC	2	6	4164	4169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714013
122	NC_008697	CAG	2	6	4176	4181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714013
123	NC_008697	GCC	2	6	4191	4196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714013
124	NC_008697	GCCG	2	8	4225	4232	0 %	0 %	50 %	50 %	119714013
125	NC_008697	GGACG	2	10	4239	4248	20 %	0 %	60 %	20 %	119714013
126	NC_008697	GAA	2	6	4272	4277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119714013
127	NC_008697	CTG	2	6	4290	4295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714013
128	NC_008697	GGT	2	6	4299	4304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119714013
129	NC_008697	CGG	2	6	4316	4321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714013
130	NC_008697	TCG	2	6	4327	4332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714013
131	NC_008697	GCA	2	6	4349	4354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714013
132	NC_008697	CG	3	6	4418	4423	0 %	0 %	50 %	50 %	119714013
133	NC_008697	CCT	2	6	4445	4450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119714013
134	NC_008697	CGC	2	6	4470	4475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714013
135	NC_008697	GGA	2	6	4539	4544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119714013
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261	NC_008697	TGC	2	6	9778	9783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714016
262	NC_008697	GAAGAT	2	12	10011	10022	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	119714016
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266	NC_008697	C	6	6	10118	10123	0 %	0 %	0 %	100 %	119714016
267	NC_008697	CGG	2	6	10125	10130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714016
268	NC_008697	TCC	2	6	10171	10176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119714016
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393	NC_008697	AGC	2	6	14382	14387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714020
394	NC_008697	CAT	3	9	14411	14419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119714020
395	NC_008697	CCT	2	6	14443	14448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119714020
396	NC_008697	CTC	2	6	14605	14610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119714021
397	NC_008697	CACC	2	8	14623	14630	25 %	0 %	0 %	75 %	119714021
398	NC_008697	CGG	2	6	14661	14666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714021
399	NC_008697	CTG	2	6	14674	14679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714021
400	NC_008697	GGT	2	6	14695	14700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119714021
401	NC_008697	TGA	3	9	14706	14714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119714021
402	NC_008697	GTC	2	6	14737	14742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714021
403	NC_008697	ACCG	2	8	14743	14750	25 %	0 %	25 %	50 %	119714021
404	NC_008697	TGA	2	6	14757	14762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119714021
405	NC_008697	GATCGT	2	12	14785	14796	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119714021
406	NC_008697	CCG	2	6	14879	14884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714021
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421	NC_008697	CGA	2	6	15485	15490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714022
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423	NC_008697	GAT	2	6	15662	15667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119714022
424	NC_008697	TCT	2	6	15672	15677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
425	NC_008697	CTT	2	6	15679	15684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
426	NC_008697	TGG	2	6	15722	15727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119714023
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430	NC_008697	GCA	2	6	15812	15817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714023
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432	NC_008697	CTG	2	6	15840	15845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714023
433	NC_008697	GCA	2	6	15857	15862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714023
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444	NC_008697	CAG	2	6	16245	16250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714023
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449	NC_008697	GGC	2	6	16359	16364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714023
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453	NC_008697	CGG	2	6	16466	16471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714023
454	NC_008697	GGTCCT	2	12	16493	16504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714023
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461	NC_008697	GC	3	6	16736	16741	0 %	0 %	50 %	50 %	119714024
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467	NC_008697	GCTC	2	8	16858	16865	0 %	25 %	25 %	50 %	119714024
468	NC_008697	TTC	2	6	16918	16923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
469	NC_008697	GGC	2	6	16953	16958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714025
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472	NC_008697	GCGGT	2	10	16993	17002	0 %	20 %	60 %	20 %	119714025
473	NC_008697	CCT	2	6	17063	17068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119714025
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489	NC_008697	GGCC	2	8	17567	17574	0 %	0 %	50 %	50 %	119714025
490	NC_008697	AGC	2	6	17585	17590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714025
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497	NC_008697	TCC	2	6	17840	17845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
498	NC_008697	GA	3	6	17846	17851	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
499	NC_008697	CAC	2	6	17888	17893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
500	NC_008697	CAC	2	6	17900	17905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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